Поставянето на гени, които обикновено не се срещат в определена храна или растение, води до генетично модифицирана храна. Земеделските производители генетично модифицират културите по една от няколко причини: да повишат устойчивостта към определени вируси или токсини, да повишат устойчивостта на пестициди и да повишат устойчивостта към някои мощни хербициди. Повечето генетични модификации имат за цел да повишат рентабилността на селското стопанство, но също така да намалят екологичните щети или щети от култури от пестициди и хербициди През 2006 г. Съединените щати са увеличили 53% от световно генетично модифицираните храни. Генетично модифицираните храни имат редица потенциално отрицателни странични ефекти.
Увреждане на други организми
Едно от най-големите възражения срещу генетично модифицираните храни е нежелан потенциал за вреда не само на хората, които ядат продуктите, но и на други организми, които могат да консумират културите. Някои генетично модифицирани храни например съдържат гени, които повишават устойчивостта към определени антибиотици. Ако това имущество е прехвърлено на човек, който яде храната, антибиотиците може да нямат обичайните ефекти срещу инфекцията.
Кръстосано замърсяване
Кръстосаното замърсяване на близките растения с полен от генетично модифицирани култури може да прехвърли определени гени от един вид растение в друг, съобщава биологът Deborah Whitman на уебсайта на ProQuest. Разделянето на полетата за отглеждане и създаването на мъжки стерилни растения, които не произвеждат цветен прашец, могат да предотвратят кръстосаното замърсяване между подобни видове, които растат в близките полета. Това вече се случи в САЩ, когато вид царевица, одобрена за употреба в храните за животни, се появи в царевицата, отглеждана за хуманна употреба, се посочва в Световната здравна организация.
Повишена устойчивост към пестициди
Увеличена съпротива се наблюдава при комарите, които развиват устойчивост към пестициди DDT. Насекомите също могат да развият устойчивост към пестицидите, произвеждани от генетично модифицирани растения, което прави по-трудно контрола на заразяването и увреждането на насекомите, отколкото трудно с течение на времето.
Алергенни ефекти
Въвеждането на генетичен материал от едно растение в друго може да доведе до въвеждането на алергенни материали от един вид в друг. Тъй като някои протеини причиняват повече алергични реакции от други, хората с тежки алергии знаят какви храни да избягват. Ако гените от тези храни са въведени в други без подходящо етикетиране, за да предупреждават тези с алергии, могат да се появят алергични реакции. Въвеждането на генетичен материал от бразилски орехи в соята бе отложено по тази причина, твърди Уитман.
Поддържане на хората информирани
Докато 60 до 70 процента от всички храни, продавани в супермаркетите в САЩ, могат да съдържат някои генетично модифицирани храни, според Кийт и Рене Шнайдер, асистенти в отдела по хранителна храна и хранене на университета във Флорида. Соевите зърна и царевицата, често срещани съставки в редица преработени храни, са най-често срещаните генетично модифицирани култури в САЩ. Но тъй като Администрацията по храните и лекарствата счита, че генетично модифицираните храни са еквивалентни на естествено произведените храни, тези храни не са етикетирани по никакъв начин ,
